Handicap International est présente en République démocratique du Congo depuis 1994. À Kinshasa, la capitale, l'association est très active sur la prévention du handicap, la santé des mères et des enfants et la sécurité routière.

À Kinshasa et dans le Kananga, elle s’attache à améliorer les services de réadaptation, en formant notamment des orthoprothésistes ou en fabriquant des aides à la mobilité (béquilles, fauteuils, etc.).

Dans le Nord-Kivu, Handicap International apporte un soutien aux plus vulnérables dans les zones affectées par une crise humanitaire chronique. Dans le Nord-Kivu et dans le Kasaï, l'association améliore la prise en charge du handicap et le suivi post-opératoire des victimes des conflits armés dans les structures de soins de santé et de réadaptation. Elle coordonne aussi une plateforme logistique favorisant l’acheminement de l’aide humanitaire vers les zones les plus reculées, en collaboration avec d’autres organisations nationales, internationales et les Nations unies. Dans le Kasaï, Handicap International améliore la sécurité alimentaire des populations affectées. L’association permet aussi aux victimes de bénéficier de soins de réadaptation et d’un soutien psychologique.

Sur l’ensemble du territoire, Handicap International renforce l’intégration des personnes handicapées dans la société et se bat pour la scolarisation des enfants handicapés. L’association soutient également plusieurs associations congolaises de défense des droits des personnes handicapées.

Enfin, l’association sensibilise les organisations humanitaires à l’inclusion des plus vulnérables, afin qu’ils soient pris en compte dans les services qu’ils proposent.

Depuis le début de l’épidémie de Covid en 2020, Handicap International intervient auprès des populations vulnérables et a adapté ses programmes dans plus de 45 pays.