En 1991, le programme au Burkina Faso a été la première mission de HI en Afrique de l'Ouest. En partenariat avec le ministère de la Santé publique, l'association a transformé un centre d'appareillage orthopédique pour anciens combattants. Elle a ensuite soutenu le développement d'autres centres de réadaptation. Aujourd'hui, HI  facilite la mise en place d'un réseau régional de réadaptation fonctionnelle et l'intégration de ce réseau dans le système national de santé. HI forme donc des professionnels de la santé et de la réadaptation fonctionnelle: plus de 120 infirmières, personnels de santé, techniciens orthoprothésistes et assistants en réadaptation ou en orthopédie ont déjà bénéficié de cette formation.

Bien que des efforts aient été faits au Burkina Faso, les personnes handicapées sont souvent confinées en marge de la société, dès les premiers jours de leur enfance. Elles n'ont pas accès à l'éducation ou à la formation professionnelle, deux domaines dans lesquels HI travaille pour améliorer leurs conditions de vie.

L'association promeut et valorise les initiatives qui visent à garantir le respect des droits fondamentaux des personnes handicapées: le droit de recevoir des soins, de travailler, de fréquenter l'école, etc. Grâce à son projet éducatif, HI facilite donc l'accès des enfants handicapés aux écoles primaires. Afin d'assurer la pérennité de ce projet, l'organisation forme et sensibilise les acteurs des secteurs du handicap et de l'éducation inclusive.
Depuis 2016, HI

mène un projet de prévention des retards de développement et des handicaps chez les enfants touchés par la malnutrition, en utilisant la physiothérapie et la stimulation physique et émotionnelle (par le biais d'interactions parents-enfants, de jeux éducatifs...). Dans ce cadre, plus de 10,000 enfants burkinabès reçoivent des soins spécifiques. HI mène également un projet spécifique pour aider à renforcer la résilience face à l'insécurité alimentaire dans la région du Sahel.

HI a commencé à travailler avec les détenus, les femmes, les enfants et les personnes handicapées en 2017. L'association leur offre un soutien personnalisé, y compris une formation professionnelle et des programmes sociaux et culturels pour faciliter la réintégration.
Depuis 2017, HI travaille aux côtés des organisations de personnes handicapées (OPH) pour s'assurer que leurs droits et besoins sont pris en compte dans la lutte contre le VIH.